Shahina B. Maqbool

PhD . Shahina B. Maqbool

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Perfiles de investigación

Intereses profesionales

Mi investigación se centra en la epigenómica, la genómica y la señalización celular. Mis especialidades de investigación incluyen la secuenciación masiva en paralelo (MPS) utilizando tecnologías de alto rendimiento disponibles como Illumina HiSeq 2500 y Roche Genome Sequencer FLX (454), la tecnología de captura de secuencias y microarrays de NimbleGen o la resecuenciación dirigida utilizando múltiples plataformas, PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR), análisis de datos y bioinformática. También tengo experiencia en diseño web, así como en lenguajes SQL y programación. He generado y utilizado recursos genómicos para revelar los mecanismos moleculares, genéticos y bioquímicos que regulan el crecimiento, el desarrollo, los metabolismos y las respuestas de estrés/defensa a varios estreses bióticos y abióticos en bacterias, hongos, plantas y Drosophila.

Publicaciones Seleccionadas

  • McPike, MP, Maqbool, SB ., Chen, L., Ouyang, W., Borer, PN Análisis paralelo de la unión de proteínas a bibliotecas de ADN utilizando chips de microarrays multiplexados. Nucleic Acid Research (NAR): 2011. (En prensa)
  • Maqbool, S.B., Mehrotra, S., Kolpakas, A, Durden, C., Zhang, B, Zhong, H. and Calvi, B.R. Dampened activity of E2F1–DP and Myb–MuvB transcription factors in Drosophila endocycling cells. J. Cell Science 123: 4095-4106, 2010.
  • Maqbool, SB ., Zhong, H., Oraby, FH y Sticklen, MB Transformación de avena y su aplicación para mejorar la tolerancia al estrés osmótico. En: ed. (Huw D. Jones y Peter R. Shewry), Trigo, cebada y avena transgénicos: protocolo de producción y caracterización. Métodos en biología molecular, vol. 478, págs. 149-168, 2009.
  • Mehrotra, S., Maqbool, SB ., Kolpakas, A., Murnen, K. y Calvi, BR. Las células endocíclicas no apoptosis en respuesta al estrés genotóxico por re-replicación del ADN. Genes & Development 22: 3158-3171, 2008.
  • Jagadeeswaran, G., Raina, S., Biswa R. Acharya, BR, Maqbool, SB ., Mosher, SL, Appel, HM, Schultz, JC, Klessig, DF, Raina, R., El gen de defensa similar a GH3 de Arabidopsis 1 es necesario para la acumulación de ácido salicílico, la activación de respuestas de defensa y la resistencia a Pseudomonas syringae . The Plant Journal 51:234-246, 2007.
  • Maqbool, SB ., Ahmad, A., Hashsham, SA Detección y cuantificación de microorganismos que eliminan fósforo en plantas de tratamiento de aguas residuales mediante PCR en tiempo real. Revista de investigación de ciencias ambientales 1: 229-236, 2007.
  • Acharya, BR, Raina, S., Maqbool, SB ., Jagadeshwaran, G., Appel, HM, Schultz, JC, Klessig , DF Raina, R., Sobreexpresión de CRK13, una quinasa similar al receptor de cisteína rica en Arabidopsis, resultados en una mayor resistencia a Pseudomonas syringae . El diario de la planta 50:488-499, 2007.
  • Maqbool, SB ., Ahmad, A., Dhawan, A., Callister, SJ, Tsoi, T., Sticklen, MB, Hashsham, SA Respuesta de genes seleccionados de la cepa LB400 de Burkholderia xenovorans al extracto de cebolla utilizando un sistema de detección de captura de híbridos de ADN:ARN. Revista de investigación de microbiología 1:378-391, 2006.
  • Ahmad, A., Maqbool, SB ., Hashsham, SA, Sticklen, MB Determinación del número de copias cryIAb y cryIAc en plantas transgénicas de arroz Basmati 370 ( Oryza sativa L.) mediante PCR en tiempo real y su comparación con Southern Blot. Journal of Biological Sciences 5:283-288, 2005.