Doctor Rajiv Pathak

Uno de nuestros principales intereses de investigación es caracterizar los bloqueos transcripcionales y postranscripcionales en la latencia del VIH-1 y cuantificar su cinética de reactivación. Para ello, hemos establecido un ensayo basado en inmunofluorescencia multiplexada de molécula única y ARN-FISH (SMIRA). Mediante SMIRA, empleamos células T y células mieloides con infección latente para estudiar la cinética de la reactivación de la latencia mediante agentes reversores de latencia (LRA). Hemos identificado con éxito diversos factores genéticos virales y del huésped responsables de la reactivación aleatoria del provirus latente.

Otro proyecto de investigación en el laboratorio se centra en el desarrollo de una nueva estrategia para detectar y estudiar la cinética de replicación del SARS-CoV-2, el virus causante de la devastadora pandemia de COVID-19. Para ello, utilizamos técnicas innovadoras para detectar el virus en las primeras etapas de la infección en modelos de líneas celulares y validamos nuestros hallazgos en muestras de autopsia a nivel de célula y molécula. Este estudio podría abrir nuevas vías para el estudio de la fisiopatología, la detección de fármacos y el diagnóstico de la COVID-19.

Nuestro tercer enfoque de investigación se centra en los tumores teratoideos/rabdoides atípicos, en los que hemos descrito hallazgos sorprendentes sobre la localización citoplasmática, hasta ahora desconocida, de SMARCB1/INI1 truncado en un número significativo de células tumorales. Posteriormente, nuestro estudio también demostró que la reversión de la exportación nuclear de SMARCB1/INI1 mediante un inhibidor aprobado por la FDA puede conducir a la rápida destrucción de las células tumorales (Pathak et al., 2021, Acta Neuropathologica; PMID: 34003336). Cabe mencionar que la depleción de la proteína nuclear SMARCB1 es un rasgo distintivo del TTAR; por lo tanto, estos hallazgos tienen implicaciones prometedoras para el desarrollo de nuevas intervenciones terapéuticas para el TTAR.

Rajiv Pathak, Carolina Eliscovich, Ignacio Mena, Updesh Dixit, Adolfo García-Sastre, Robert H Singer, Ganjam V. Kalpana (2022) Visualización de la cinética de replicación temprana del ARN del SARS-CoV-2 mediante el uso de ARN-FISH de molécula única. bioRxiv (https://doi.org/10.1101/2022.12.10.517707).

Rajiv Pathak^#Francesca Zin ^#, Christian Thomas, Susanne Bens, Tenzin Gayden, Jason Karamchandani, Roy W. Dudley, Karolina Nemes, Pascal D. Johann, Florian Oyen, Uwe Kordes, Nada Jabado, Reiner Siebert, Werner Paulus, Marcel Kool, Michael C. Frühwald, Steffen Albrecht, Ganjam V. Kalpana ^$ y Martin Hasselblatt ^$ (2021) La inhibición de la exportación nuclear restaura la localización nuclear y la función supresora tumoral residual de la proteína SMARCB1/INI1 truncada en un subconjunto molecular de tumores teratoideos/rabdoides atípicos. Acta Neuropathologica, 142(2):361-374. ( ^# contribución equivalente)(SI-15.887)

Updesh Dixit, Savita Bhutoria, Xuhong Wu, Liming Qiu, Menachem Spira, Sheeba Mathew, Richard Harris, Lucas J. Adams, Sean Cahill, Rajiv Pathak, P. Rajesh Kumar, Minh Nguyen, Seetharama A. Acharya, Michael Brenowitz, Steven C. Almo, Xiaoqin Zou, Alasdair C. Steven, David Cowburn, Mark Girvin y Ganjam V. Kalpana (2021) El dominio Rpt1 de INI1/SMARCB1 imita la unión del ARN TAR a la integrasa para facilitar la replicación del VIH-1. Nature Communications, 12(1):2743-2758. (SI-17.694)

Diksha Jha, Prasanna Kumar Thiruveedula, Rajiv Pathak, Bipul Kumar, Hemant K. Gautam, Shrish Agnihotri, Ashwani Kumar Sharma, Pradeep Kumar (2017) Nanopartículas de plata biosintetizadas multifuncionales que presentan un excelente potencial antimicrobiano contra microbios resistentes a múltiples fármacos, además de notables propiedades anticancerígenas. Ciencia e Ingeniería de Materiales C 80:659–669. (SI-8.457)

Ruby Bansal, Rajiv Pathak, Bipul Kumar, Hemant K. Gautam, Pradeep Kumar (2017) Actividad antimicrobiana mejorada de polímeros catiónicos anfifílicos contra una amplia gama de cepas bacterianas y microbios cutáneos. Colloid and Polymer Science, 295:1177-1185 (SI-2.434)

Bipul Kumar ^$, Rajiv Pathak ^$, P. Bertin Marry, Diksha Jha, Kabir Sardana, Hemant K. Gautam (2016) Nuevos conocimientos sobre la patogénesis del acné: exploración del papel de las poblaciones microbianas asociadas al acné. Dermatologica Sinica, 34(2):67-73 ^$(Co-primer autor) (SI-1.107)

Bipul Kumar, Anurag Mathur, Rajiv Pathak, Kabir Sardana, Hemant K. Gautam, Pradeep Kumar (2016) Evaluación de la eficacia antimicrobiana de la poli[bis(2-cloroetil)éter-alt-1,3-bis[3-(dimetilamino)propil]urea] cuaternizada contra bacterias patógenas específicas y resistentes a múltiples fármacos. Journal of Bioactive and Compatible Polymers, 31(5) 467–480 (SI-1.756)

Ruby Bansal ^$, Rajiv Pathak ^$, Diksha Jha, Pradeep Kumar, Hemant K. Gautam (2015) Actividad antimicrobiana mejorada de polímeros híbridos de amino-fosfonio (NP) contra bacterias gramnegativas y grampositivas. Revista Internacional de Materiales Poliméricos y Biomateriales Poliméricos, 64(2):84-89 ^$(Co-primer autor) (SI-3.221)

Shrish Agnihotri, Rajiv Pathak, Diksha Jha, Indrajit Roy, Hemant K. Gautam, Ashwani K. Sharma, Pradeep Kumar (2015) Síntesis y actividad antimicrobiana de nanopartículas de sílice conjugadas con aminoglucósidos contra bacterias clínicas y resistentes. New Journal of Chemistry. 39:6746-6755. (Artículo de portada) (SI-3.925)

Santosh Yadav, Manohar Mahato, Rajiv Pathak, Diksha Jha, Bipul Kumar, Smriti Rekha Deka, Hemant Kumar Gautam, Ashwani Kumar Sharma (2014) Nanoestructuras peptídicas catiónicas autoensambladas multifuncionales transportan eficientemente ADN plasmídico in vitro y exhiben actividad antimicrobiana con mínima toxicidad. Journal of Materials Chemistry B. 2(30):4848-4861. (SI-7.571)

Rajiv PathakPankaj Narang, Muktesh Chandra, Raj Kumar, PK Sharma, Hemant K. Gautam (2014) Modelado de homología y perfil comparativo de la superóxido dismutasa en extremófilos: Exiguobacterium como organismo modelo. Revista India de Microbiología 54(4):450-458 (SI-2.461)

Nicolas Beaume ^$, Rajiv Pathak ^$, Vinod Kumar Yadav, Swathi Kota, Hari S. Misra, Hemant K. Gautam, Shantanu Chowdhury (2013) Un estudio de todo el genoma predice que los motivos de ADN del promotor G4 regulan funciones selectivas en bacterias: la radiorresistencia de D. radiodurans implica una regulación mediada por el ADN G4. Nucleic Acids Research . 41(1):76-89. ^$(Co-primer autor) (SI-19.16)

Aaradhita Baral, Pankaj Kumar, Rajiv Pathak, Shantanu Chowdhury (2013) Tendencias emergentes en la biología del G-cuadrúplex: papel en eventos epigenéticos y evolutivos. Biosistemas moleculares. 9:1568-1575. (SI-4.212)

Rajiv PathakRaj Kumar y Hemant K. Gautam (2013) Inducción y mejora de las propiedades antimicrobianas entre especies en respuesta a la radiación gamma en Exiguobacterium sp. HKG 126. Revista India de Microbiología 53(2):130-136 (SI-2.461)

Manohar Mahto, Varun Arora, Rajiv Pathak, Hemant K. Gautam, Ashwani Kumar Sharma (2012) Fabricación de nanoestructuras mediante autoensamblaje molecular de pequeños glicodeshidropéptidos anfifílicos. Biosistemas moleculares 8:1742-1749. (SI-4.212)

Anil Kumar Gupta, Rajiv Pathak, Bharat Singh, Hemlata Gautam, Ram Kumar, Raj Kumar, Rajesh Arora y Hemant K. Gautam (2011) Análisis proteómico de los cambios globales en la expresión proteica durante la exposición a radiación gamma en Bacillus sp. HKG-112 aislado de suelo salino. Journal of Microbiology and Biotechnology , 21(6):574-581. (SI-3.277)