PhD Steven C. Almo

Nuestro laboratorio está interesado en el desarrollo y la aplicación de estrategias y tecnologías que permitan la exploración de funciones biológicas a gran escala y con un alto rendimiento. Estos esfuerzos suelen aprovechar la automatización y la robótica para lograr la eficiencia y la velocidad necesarias para alcanzar las tasas deseadas de generación y descubrimiento de datos. Esta infraestructura de vanguardia se ha aplicado a varias áreas biomédicas importantes para lograr nuevos conocimientos y nuevas oportunidades terapéuticas.

Nuestro trabajo sobre la anotación a gran escala de la función enzimática está ayudando a definir el repertorio metabólico que existe en la naturaleza y está proporcionando nuevos conocimientos sobre las contribuciones del microbioma intestinal a la salud humana, la realización de nuevos procesos químicos para la industria y la ampliación de nuestra comprensión de cuestiones ambientales críticas, incluidos los ciclos globales de nutrientes y la evolución de comunidades microbianas complejas. Nuestro análisis estructural y funcional de alta resolución del sistema inmunológico de los mamíferos ha dado como resultado una comprensión sin precedentes de los mecanismos moleculares que controlan la inmunidad y están guiando el desarrollo de nuevas estrategias y reactivos (por ejemplo, productos biológicos) para el tratamiento de enfermedades infecciosas, enfermedades autoinmunes y cánceres.

Quayle SN, Girgis N, Thapa DR, Merazga Z, Kemp MM, Histed A, Zhao F, Moreta M, Ruthardt P, Hulot S, Nelson A, Kraemer LD, Beal DR, Witt L, Ryabin J, Soriano J, Haydock M, Spaulding E, Ross JF, Kiener PA, Almo S, Chaparro R, Seidel R, Suri A, Cemerski S, Pienta KJ, Simcox ME. (2020) "CUE-101, una nueva proteína de fusión E7-pHLA-IL2-Fc, mejora la activación de células T específicas del antígeno tumoral para el tratamiento de neoplasias malignas impulsadas por HPV16". Clin Cancer Res. 26(8), 1953-1964. PMID:31964784.

Funabashi M, Grove TL, Wang M, Varma Y, McFadden ME, Brown LC, Guo C, Higginbottom S, Almo SC, Fischbach MA. (2020) "Una vía metabólica para la deshidroxilación de ácidos biliares por el microbioma intestinal". Nature 582(7813), 566-570. PMC7319900.

Liu W, Garrett SC, Fedorov EV, Ramagopal UA, Garforth SJ, Bonanno JB, Almo SC. (2019) "Base estructural del reconocimiento de CD160:HVEM". Structure 27(8), 1286-1295.e4. PMC7477951.

Gizzi AS, Grove TL, Arnold JJ, Jose J, Jangra RK, Garforth SJ, Du Q, Cahill SM, Dulyaninova NG, Love JD, Chandran K, Bresnick AR, Cameron CE, Almo SC. (2018) “Un ribonucleótido antiviral natural codificado por el genoma humano”. Nature 558, 610-614. PMC6026066.

Ghosh A, Ramagopal UA, Bonanno JB, Brenowitz M, Almo SC. (2018) “Las estructuras del dominio L27 de la proteína Disc Large Homologue 1 ilustran un módulo de autoensamblaje”. Biochemistry 57, 1293-1305. PMC6568269.

Ramagopal UA, Liu W, Garrett-Thomson SC, Bonanno JB, Yan Q, Srinivasan M, Wong SC, Bell A, Mankikar S, Rangan VS, Deshpande S, Korman AJ, Almo SC. (2017) “Base estructural para la inmunoterapia contra el cáncer mediante el inhibidor de puntos de control de primera clase ipilimumab”. Proc Natl Acad Sci USA . 114, E4223-E4232. PMC5448203.

Lázár-Molnár E, Scandiuzzi L, Basu I, Quinn T, Sylvestre E, Palmieri E, Ramagopal UA, Nathenson SG, Guha C, Almo SC. (2017) “Desarrollo guiado por la estructura de una célula humana de muerte programada-1 de alta afinidad: implicaciones para la inmunoterapia tumoral”. EBioMedicine. 17, 30-44. PMC5360572.

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Liu W, Ramagopal U, Cheng H, Bonanno JB, Toro R, Bhosle R, Zhan C, Almo SC. (2016) “Estructura cristalina del complejo de FasL humano y su receptor señuelo DcR3”. Structure 24, 2016-2023. PMID:27806260.

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Vetting MW, Al-Obaidi N, Zhao S, San Francisco B, Kim J, Wichelecki DJ, Bouvier JT, Solbiati JO, Vu H, Zhang X, Rodionov DA, Love JD, Hillerich BS, Seidel RD, Quinn RJ, Osterman AL, Cronan JE, Jacobson MP, Gerlt JA, Almo SC. (2015) “Estrategias experimentales para la anotación funcional y el descubrimiento del metabolismo: cribado dirigido de proteínas de unión a solutos y cribado imparcial de metabolomas”. Biochemistry 54, 909-931. PMC4310620.

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Kim J, Xiao H, Bonanno JB, Kalyanaraman C, Brown S, Tang X, Al-Obaidi NF, Patskovsky Y, Babbitt PC, Jacobson MP, Lee YS, Almo SC. (2013) “Descubrimiento guiado por la estructura del metabolito carboxi-SAM que modula la función del ARNt”. Nature 498, 123-126. PMC3895326.

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Vigdorovich V, Ramagopal UA, Lázár-Molnár E, Sylvestre E, Lee JS, Hofmeyer KA, Zang X, Nathenson SG, Almo SC. (2013) “Estructura y propiedades de inhibición de células T del miembro de la familia B7, B7-H3”. Structure 21, 707-717. PMC3998375.

Soniat M, Sampathkumar P, Collett G, Gizzi AS, Banu RN, Bhosle RC, Chamala S, Chowdhury S, Fiser A, Glenn AS, Hammonds J, Hillerich B, Khafizov K, Love JD, Matikainen B, Seidel RD, Toro R, Rajesh Kumar P, Bonanno JB, Chook YM, Almo SC. (2013) “Estructura cristalina de la carioferina β2 humana unida al PY-NLS de Saccharomyces cerevisiae Nab2”. J Struct Funct Genomics 14, 31-35. PMC3681870.

Sampathkumar P, Kim SJ, Upla P, Rice WJ, Phillips J, Timney BL, Pieper U, Bonanno JB, Fernandez-Martinez J, Hakhverdyan Z, Ketaren NE, Matsui T, Weiss TM, Stokes DL, Sauder JM, Burley SK, Sali A, Rout MP, Almo SC. (2013) “Estructura, dinámica, evolución y función de un componente de andamiaje principal en el complejo de poros nucleares”. Structure 21, 560-571. PMC3755625.